В 1931 году на центральной усадьбе совхоза «Заря» была открыта начальная школа.
В 1933 году школа стала семилетней. Первым директором неполной средней школы был Ермолин Николай Павлович.
В 1934 году школу перевели в отдельное саманное здание, где она работала до 1948 года.
В 1949 году решили выделить специальное здание – двухэтажный купеческий дом. Директорами Заринской школы до 1949 года были: Карпенко Василий Дмитриевич, Остапенко Василий Денисович, Ермолюк Николай Павлович, Брушкова Анна Фёдоровна, Рябченко Степан Петрович, Лобова Мария Антоновна.
1 сентября 1949 года неполная средняя школа была преобразована в Заринскую среднюю школу, руководителем которой стал Ярошенко Андрей Евтихиевич. В 8-10 классах обучение было платное. В средней школе первой пионервожатой была Нечаева Мария Петровна (Шмырёва). Художественной самодеятельностью в школе руководил Губарев Пётр Васильевич.
В 1958 году было построено типовое здание школы. В нём было 9 классных комнат, большой коридор, позже к нему пристроили спортивный зал. За это время в школе менялось руководство: Ярошенко А.Е. сменили Грошев Пётр Павлович, Ключников Юрий Михайлович, Яшинский Георгий Иосифович. С осени 1962 года директором школы назначен Аверин Михаил Андриянович.
В 1968 –1969 учебном году в школе был уже 21 класс–комплект, работала вечерняя школа. Встал вопрос о строительстве нового здания школы. Аверин М.А. в течение 9 лет со всех трибун просил, доказывал, объяснял необходимость строительства нового здания.
А 12 января 1976 года начались занятия в школе в 23 кабинетах в одну смену, все классы были переведены на продлённый день. Уроки, выполнение домашних заданий, работа секций и кружков, занятия музыкой, хореографией, рисунком, ритмикой, спортом входили в школьное расписание.
26 февраля 1983 года школа получила телеграмму о присвоении Аверину М.А. звания «Народный учитель СССР».
В 2006 году школа получила грант 1 млн. рублей за победу в федеральном конкурсе лучших общеобразовательных учреждений, внедряющих инновационные образовательные программы.
В январе 2010 года на базе школы открылась областная экспериментальная площадка по теме «Разработка и реализация муниципальных систем профильного обучения», научный руководитель Касаткина Наталья Эмильевна, доктор педагогических наук, профессор, академик МАНВШ и АПСН, заслуженный работник Высшей школы РФ, лауреат премии правительства Российской Федерации в области образования.
С 1 сентября 2010 года школа работает по введению ФГОС НОО в пилотном режиме. В 2011 году школа получила грант 1 млн. 300 тыс. рублей из регионального бюджета. С 2012 года школа начала работу в пилотном режиме по введению ФГОС ООО.
С сентября 2016 года школа стала базовой площадкой КРИПК и ПРО г. Кемерово по пилотной апробации ФГОС СОО.
В 2017 году МБОУ «Заринская средняя общеобразовательная школа имени М.А. Аверина» вошла в 300 лучших сельских школ РФ.
В январе 2018 года школа участвовала в областном конкурсе «Инновации в образовании». с проектом «Создание единого воспитательного пространства школы в условиях введения ФГОС общего образования», который получил диплом 2 степени. А в 2019 году с проектом «Создание системы работы по организации непрерывного трудового обучения и воспитания в условиях сельской школы» — диплом 2 степени.
С сентября 2016 года школа стала базовой площадкой КРИПК и ПРО г. Кемерово по пилотной апробации ФГОС СОО (Приказ ДОиН Кемеровской области №1006 от 06.06.2016г.).
С сентября 2014 года на базе школы действовала региональная инновационная площадка по направлению «Профильное и профессиональное самоопределение школьников» по теме «Организация предпрофильной подготовки школьников сельских ОО в условиях реализации внеурочной деятельности ФГОС (7-9 класс)», а с сентября 2017 года по теме «Реализация внеурочной деятельности старших школьников с целью формирования их профессионального самоопределения». А в 2019 году школа стала федеральной опытно -экспериментальной площадкой по апробации примерной программы воспитания института стратегии развития образования РАО.
С 2019 года школа является участником регионального проекта «Современная школа». В рамках этого проекта успешно работает центр цифрового и гуманитарного профиля «Точка роста».
Весной 2020 года коллектив начал сотрудничество с научным образовательным центром «Кузбасс» в рамках проекта «Цифровая агрономия». Неоднократно школа принимала научный десант молодых ученых ВУЗов Кузбасса, участники которого проводии профориентационные мероприяти для старшеклассников «Шаг в науку».
В 2022 году коллектив школы стал призером регионального этапа конкурса «Лучшая инклюзивная школа» и победителем регионального конкурса «Эколидер -2022».
